学会発表 McCairn KW, Nagai Y, Kimura K, Go Y, Inoue K, Isoda M, Minamimoto T, Matsumoto M, Takada M. Spontaneously Emerging Parkinsonism-Cerebellar Syndrome in a Subspecies of Japanese Macaque (Macaca fuscata yakui): A Potential Analogue of Multiple System Atrophy.(September 12, 2014) The 37th Annual Meeting of the Japan Neuroscience Society.(Yokohama, Japan).
McCairn KW, Nagai Y, Hori Y, Iriki A, Takada M, T Minamimoto, Isoda M, Matsumoto M. Distinct cortical and subcortical networks drive myoclonic and vocal tics in the nonhuman primate model of Tourette syndrome: A PET and electrophysiological study(November 18, 2014) The 44th Annual Meeting of the Society for Neuroscience(Washington DC, USA).
運動異常症の霊長類モデルにおける脳活動異常の電気生理学的解析
磯田 昌岐 , 松本 正幸, Kevin McCairn
トゥレット症候群は，運動チックと発声チックを主徴とする運動異常疾患である。本研究では各チック症状の病態生理学的機構を明らかにするため，同疾患の霊長類モデルを薬理学的手法により作出し，大脳皮質と大脳基底核の神経活動を電気生理学的に解析した。まず，GABA-A受容体の拮抗薬であるbicucullineをマカクザルの被殻と側坐核に微量注入し，それぞれ運動チックと発声チックを誘発することに成功した。次いで，大脳皮質運動野，前部帯状皮質，被殻，側坐核より局所電場電位local field potentialsを記録し，各チック症状出現後の神経活動を比較した。その結果，運動チックの発現時には大脳皮質運動野と被殻において顕著な異常活動が記録され，発声チックの発現時には前部帯状皮質と側坐核において顕著な異常活動が記録された。本研究の実施により，トゥレット症候群の運動チックと発声チックの発現には，大脳皮質・基底核系の異なるネットワークが関与することが示唆された。
学会発表 Hoshi E Structural and functional organization of the frontal association cortex for goal-directed behavior(2014.07) 9th FENS Forum of Neuroscience(Milan, Italy).
Hoshi E Cortico-basal ganglia networks subserving goal-directed behavior mediated by conditional visuo-goal association(2014/09) NIPS International Workshop and Satellite Symposium of Neuroscience2014(Okazaki, Japan).
Phylogenetic and population genetic studies for conservation of nonhuman primates in Myanmar.
Phylogenetic and population genetic studies for conservation of nonhuman primates in Myanmar.
Aye San
Myanmar is located in the center of Continental Southeast Asia, and holds a variety of habitat environment for nonhuman primates. Hence, high diversity of nonhuman primates are described: 3 species of gibbons, 7 species of leaf monkeys, 5 species of macaques and one species of the slow loris. This research aims to see phylogenetic relationship among the local populations of Myanmar non-human primates by analyzing DNA sequences of highly variable region of mtDNA, as well as to confirm phylogenetic status of Myanmar monkeys by constructing phylogenetic trees together with DNA sequence data of monkeys from other countries. In 2014, the 1st year of the planned research “International Cooperative Research on Evolution and Conservation of Asian Primates”, I conducted those examinations on the Myanmar subspecies of the long-tailed monkey (Macaca fascicularis aurea). To see mtDNA phylogeography, I sequenced the D-loop region for the samples collected in 11 localities and infer phylogenetic tree using approximate 560 bp of hyper variable region 1 of D-loop. The result suggested a relatively large genetic differentiation among local populations of M. f. aurea in Myanmar. However, in one case transportation of monkey by humans was suspected. Next, I sequenced approximate 1470 bp of the 12S-16S region for 5 samples of M. f aurea and 12 individuals representing 9 species (M. arctoides, M. assamensis, M. fascicularis, M. fuscata, M. leonina, M. mulatta, M. nemestrina, M. silenus and M. thibetana). All the 5 samples of aurea, including 3 pets and 2 fecal DNA samples from Indian Single Rock Mountain (Southern Myanmar) showed an identical sequence for this region. In the species-level phylogenetic tree, M. f. aurea was placed at the basal position, not forming a cluster with other subspecies of M. fascicularis from Laos and Sumatra. These results will be helpful to find evolutionary significant units for conservation of Myanmar’s endemic subspecies of the long-tailed monkey.
Takashi Kawai, Hiroshi Yamada, Nobuya Sato, Masahiko Takada, Masayuki Matsumoto The lateral habenula and anterior cingulate cortex in primates differentially represent past negative outcome and subsequent behavioral shift(2014年9月11日) 第37回日本神経科学大会(横浜).
Takashi Kawai, Hiroshi Yamada, Nobuya Sato, Masahiko Takada, Masayuki Matsumoto Representation of past negative outcome and subsequent behavioral shift in the primate lateral habenula and anterior cingulate cortex(2014年11月16日) 44th annual meeting of Society for Neuroscience(Washington DC).
Takashi Kawai, Hiroshi Yamada, Nobuya Sato, Masahiko Takada, Masayuki Matsumoto Past outcome monitoring and subsequent behavioral adjustment in the primate lateral habenula and anterior cingulate cortex during a reversal learning task(2014年12月6日) VMT2014”Vision, Memory, Thought: how cognition emerges from neural network”(東京).
論文 Ohi K, Hashimoto R, Ikeda M, Yamamori H, Yasuda Y, Fujimoto M, Umeda-Yano S, Fukunaga M, Fujino H, Watanabe Y, Iwase M, Kazui H, Iwata N, Weinberger DR, Takeda M. (2015) Glutamate Networks Implicate Cognitive Impairments in Schizophrenia; Genome-Wide Association Studies of 52 Cognitive Phenotypes. Schizophrenia Bulletin 41(4):909-18.
Hashimoto R, Ikeda M, Yamashita F, Ohi K, Yamamori H, Yasuda Y, Fujimoto M, Fukunaga M, Nemoto K, Takahashi T, Ochigi M, Onitsuka T, Yamasue H, Matsuo K, Iidaka T, Iwata N, Suzuki M, Takeda M, Kasai K, Ozaki N.(2014) Common variants at 1q36 are associated with superior frontal gyrus volume. Translational Psychiatry 4:e472.
Iwata R, Ohi K, Kobayashi Y, Masuda A, Masuda A, Iwama M, Yasuda Y, Yamamori H, Tanaka M, Hashimoto R, Itohara S, Iwasato T.(2014) RacGAP α2-chimaerin function in development adjusts cognitive ability in adulthood. Cell Report 8(5):1257-64.
Nishizawa D, Ohi K, Hashimoto R, Yamamori H, Yasuda Y, Fujimoto M, Umeda-Yano S, Takeda M, Ikeda K. (2014) Association between genetic polymorphism rs2952768, close to the METTL21A and CREB1 genes, and intellectual ability in healthy subjects. Journal of Addiction Research & Therapy 5(2):1000178.
Yasuda Y, Hashimoto R, Ohi K, Yamamori H, Fujimoto M, Umeda-Yano S, Fujino H, Horiguchi M, Takeda M, Ichinose H. (2014) A functional polymorphism of the GTP cyclohydrolase I gene predicts attention performance. Neurosci Lett 566(2014):46?49.
Toriumi K, Kondo M, Nagai T, Hashimoto R, Ohi K, Song Z, Tanaka J, Mouri A, Koseki T, Yamamori H, Furukawa-Hibi Y, Mamiya T, Fukushima T, Takeda M, Nitta A, Yamada K, Nabeshima T.(2014) Deletion of SHATI/NAT8L increases dopamine D1 receptor on the cell surface in the nucleus accumbens, accelerating methamphetamine dependence. Int J Neuropsychopharmacol, 17:443-453.
論文 Matsushima, A. & Tanaka, M.(2014) Different neuronal computations of spatial working memory for multiple locations within versus across visual hemifields. J. Neurosci. 34:5621-5626..
Matsushima, A. & Tanaka, M.(2014) Differential neuronal representation of spatial attention dependent on relative target locations during multiple object tracking. J. Neurosci. 34:9963-9969.
Yoshida, A. & Tanaka, M.( in press) Two types of neurons in the primate globus pallidus external segment play distinct roles in antisaccade generation. Cereb. Cortex in press.
Kunimatsu J., Suzuki T & Tanaka M. Anti-saccade signals in the primate cerebellar dentate nucleus.(2014.9.11) 日本神経科学大会(横浜).
Matsuyama K. & Tanaka M. Neuronal correlates of temporal prediction in the primate central thalamus.(2014.9.11) 日本神経科学大会(横浜).
Kunimatsu J., Suzuki T & Tanaka M. Contribution of the cerebellar dentate nucleus to the generation of anti-saccades.(2014.11.15) 北米神経科学学会(ワシントンDC).
Matsuyama K. & Tanaka M. Neurons in the primate central thalamus predicting the timing of periodic stimulus.(2014.11.18) 北米神経科学学会(ワシントンDC).
Matsuyama K. & Tanaka M. Role of the primate thalamus in temporal prediction.(2014.12.6) nternational Symposium “Vision, Memory, Thought” (organized by Yasushi Miyashita)(東京).
伊藤健史、田中真樹 Spatiotemporal adaptation of predictive saccades in monkeys.(2015.3.21) 第92回日本生理学会(神戸).
植松明子、田中真樹 Effects of electrical microstimulation to the primate cerebellar dentate nucleus on the detection of stimulus omission in the missing oddball paradigm.(2015.3.23) 第92回日本生理学会(神戸).
論文 Kato, S., Kobayashi, K., and Kobayashi, K.(2014) Improved transduction efficiency of a lentiviral vector for neuron-specific retrograde gene transfer by optimizing the junction of fusion envelope glycoprotein. J. Neurosci. Methods 227:151-158.
Kobayashi, K., Kato, S., and Kobayashi, K. Improvement of gene transduction efficiency for neuron-specific retrograde gene transfer lentiviral vector with a novel fusion envelope glycoprotein. (November 18, 2014) 44th Annual Meeting of Society for Neuroscience(Washington DC).
霊長類に特異的なイムノトキシン神経路標的法の開発
小林 和人 , 加藤 成樹, 伊原 寛一郎
霊長類の高次脳機能の基盤となる脳内メカニズムの解明とゲノム科学との融合のために、複雑な神経回路における情報処理とその調節の機構の理解が必要である。我々は、これまでに、高田教授の研究グループと共同し、高頻度な逆行性遺伝子導入を示すウイルスベクター(HiRet/NeuRetベクター）を用いて特定の神経路を切除する遺伝子操作技術を開発した。この神経路標的法では、ヒトインターロイキン-2受容体αサブユニット(hIL-2Rα)遺伝子を発現するNeuRetベクターを脳に注入することにより、そこへ入力する神経路にhIL-2Rα遺伝子を発現させ、その後特定脳領域にhIL-2Rαに対して選択的に作用する組換え体イムノトキシンを投与することによって、目的の神経路の選択的除去を誘導する(Inoue et al., 2012)。しかし、このイムノトキシンはサルIL-2Rαに交差反応する可能性があり、標的細胞への選択性を高めるために、サルIL-2Rαに反応せず、マウスIL-2Rα(mIL-2Rα)に選択的に作用する新たなイムノトキシン（anti-mCD25-PE38）の開発を試みた。mIL-2Rαを用いて免疫化したラットより調製された３種類の抗体（3C7, 2E4, PC61）について、ハイブリドーマから得た遺伝子配列に基づきVHとVL領域を単一ペプチドとして連結し、緑膿菌体外毒素の膜貫通・触媒ドメインに融合したイムノトキシンを発大腸菌で発現させ、精製し、イムノトキシンの性能をin vitroの結合実験により評価した。しかし、これらのタンパク質のmIL-2Rαに対する結合親和性が従来のイムノトキシンに比較して高くないことが判明した。したがって、今後は、VHとVL領域をさらに改変し、新たなイムノトキシン分子を開発する必要がある。他のモノクローナル抗体を入手し、この領域について別の配列を利用する計画である。また、マカクザル脳内おける各種融合糖タンパク質(FuG-B2, FuG-C, FuG-E型)のウイルスベクター導入効率を比較するために、それぞれのベクターをマカクザルの線条体に注入した。今後、各経路への導入の頻度を組織学的に解析する予定である。また、マーモセット脳内での導入効率を調べるための同様の実験を計画した。これについても、今後、注入実験を進める計画である。
This study was aimed to investigate the genetic structure of an isolated population of Taiwanese macaques located at the mountain range in central Taiwan, in order to examine how human activities impact the gene flow. The HVR I of mtDNA was sequenced and analyzed from fecal samples of social group members as well as out-side group males collected at this site. The haplotypes (650 bp) of 3 neighboring groups (F1, F2 and F3 groups) at a highly provisioned trail were different from each other by 11, 42 and 38 bp of substitutions, respectively. However, F1 group may be the group that was original at the trail when the provisioning had not occurred. We found that the F1 haplotype was 0-3 bp different from haplotypes of other social groups inhabited in the same region. F2 and F3 groups could move to this area due to human provisioning activity, or be translocated to this area. Six adult male samples collected at the highly provisioned trail were successfully sequenced on the HVRI. Four males carried the same haplotypes carried by 2 of the 3 neighboring groups at this trail, among which 2 males transferred to neighboring groups and the other two may make a short distance dispersal in the same region. The other two males that carried different haplotypes may disperse from other regions that need to be verified in the future. The preliminary results suggested that the genetic structure of this isolated population of Taiwanese macaques may be highly impacted by human activities. Keywords: mtDNA, provisioning, male dispersal, Macaca cyclopis
岡本-Barth 早苗 , Robin M. Bernstein, Rob Knight, Carlito Lebrilla
本研究は現在も継続中であり、27年度も引き続き、共同利用研究として継続希望が採択されている。本研究では2000年から数年に渡り思考言語分野において採取、冷凍保存されていたチンパンジーの母乳サンプルを調べることにより、ヒトとチンパンジーにおける代謝および免疫に関係する因子の比較をおこなう。またチンパンジーの授乳期間が長いことから、母乳中の因子と乳児の発達との関係性を調べる。さらに同様に採取された母子の糞尿サンプルもあわせて調べることにより、乳児の発達に伴った母子の生理学的変化を総合的に検討する。26年度は、母乳サンプル輸出について、ワシントン条約に基づいたCITES（Convention on International Trade in Endangered Species）手続きのためチンパンジー3個体各々の書類準備をおこなったが、個体履歴等の証明書類の完備が困難で手続きが長期化することが予想された。そのため、コロラド大学の研究協力者が来日して所内の実験室において、分析をおこなう方針に変更した。しかし、当初予定していた分析試薬の国内入手が困難であることが判明した。そこで、27年度にはハーバード大学の研究協力者を新たに追加して、異なる分析キットを用いて母乳の分析を開始することを予定している。
H26-A19 代:南本 敬史
遺伝子発現の生体内可視化と脳機能制御技術の確立
学会発表 Yuji Nagai, Erika Kikuchi, Walter Lerchner, Ken-ichi Inoue, Arata Oh-Nishi, Hiroyuki Kaneko, Yoko Kato, Yukiko Hori, Bin Ji, Katsushi Kumata, Ming-Rong Zhang, Ichio Aoki, Tetsuya Suhara, Masahiko Takada, Makoto Higuchi, Barry J Richmond, Takafumi Minamimoto In vivo PET imaging of the behaviorally active designer receptor in macaques (2014.9.13) 日本神経科学学会(横浜).
Yuji Nagai, Erika Kikuchi, Walter Lerchner, Ken-ichi Inoue, Arata Oh-Nishi, Hiroyuki Kaneko, Yoko Kato, Yukiko Hori, Bin Ji, Katsushi Kumata, Ming-Rong Zhang, Ichio Aoki, Tetsuya Suhara, Masahiko Takada, Makoto Higuchi, Barry J Richmond, Takafumi Minamimoto In vivo PET imaging of the behaviorally active designer receptor in macaque monkeys (2014.11.17) Society for Neuroscience(Washington DC).
Yuji Nagai, Erika Kikuchi, Walter Lerchner, Ken-ichi Inoue, Arata Oh-Nishi, Hiroyuki Kaneko, Yoko Kato, Yukiko Hori, Bin Ji, Katsushi Kumata, Ming-Rong Zhang, Ichio Aoki, Tetsuya Suhara, Masahiko Takada, Makoto Higuchi, Barry J Richmond, Takafumi Minamimoto In vivo imaging of designer receptor that enables to modify reward-related behavior in monkeys(2014.12.13) 包括脳ネットワーク冬のシンポジウム(東京医科歯科大学).
遺伝子発現の生体内可視化と脳機能制御技術の確立
南本 敬史
DREADD(Designer Receptor Exclusively Activated by Designer Drug)は化学遺伝学的手法のひとつであり，変異型ムスカリン受容体が選択的リガンドclozapine-n-oxide(CNO)により活性化されることで，発現している神経細胞を抑制(あるいは興奮）させる．我々はこれまでにDREADD受容体の発現を生体で可視化する方法として，選択的放射性PETリガンド[11C]CLZを見出し，DREADDの生体PETイメージング法を開発した．この基礎技術と所内対応者である高田らが有する経路選択的な遺伝子導入法などウイルスベクター開発技術を組み合わせることで，より汎用な脳内遺伝子発現の経時的かつ非侵襲的なモニタリング技術を開発し，霊長類における特定神経回路の薬物による操作技術を確立することを目的とした． 平成26年度は，サル線条体に局所注入したレンチウィルスベクターによるhM4Di-DREADDの発現の位置と発現レベルを生きたまま追跡可能となるPETイメージング法を確立した．また同イメージング法により，発現したDREADDを占有するのに十分なCNO投与量を推定した．実際に推定したCNO投与により，抑制性DREADD(hM4Di)を両側の内側尾状核に発現させた2頭のマカクサルの報酬獲得行動に障害を引き起すことが繰り返し確認できた．これらの結果は，開発したイメージング法とDREADDを用いた脳機能制御法がサル脳機能研究において非常に有効であることを示す．
H26-A20 代:村井 千寿子
霊長類における時空間的な対象関係の理解に関する比較研究
学会発表 Chizuko Murai, Michiko Miyazaki, Masaki Tomonaga, Hiroyuki Okada, Mutsumi Imai The origin of a uniquely human thinking bias: The symmetry inference bias in human infants and chimpanzees (July 3-5) Proceedings of the 20th international conference on infant studies(Berlin).
Chizuko Murai, Michiko Miyazaki, Masaki Tomonaga, Hiroyuki Okada, Mutsumi Imai THE ORIGIN OF A HUMAN-UNIQUE INFERENCE BIAS: THE SYMMETRY INFERENCE BIAS IN HUMAN INFANTS AND CHIMPANZEES(August11-16) The 25 th Congress of the International Primatological Society(Vietnum).
Study on phylogeography of macaques and langurs in Nepal
Study on phylogeography of macaques and langurs in Nepal
Mukesh Chalise
We planned to conduct a population genetic assessment on Nepalese wildlife. We continue ecological observations and have collected fecal samples of non-human primates in Nepal for the phylogeographical study. The aim of this program is to increase geographical information to evaluate ecological and evolutionary status of rhesus and Assamese macaques and Himalayan langurs from DNA analysis. In this year’s program, we increased samples of primates from Inner Tarai, Mid-hills and upper mountain regions of Nepal. We have gone through some analysis. However, still we want to cover the wider areas of Nepal where primates are observed by local collaborator. We had used the facilities and deposited samples in a laboratory of KUPRI to do PCR, DNA sequencing and computer analysis, then could establish a protocol of the DNA analysis which is applicable to the primate populations living in Himalayan region. Using the sampling method, samples were collected from different localities in Nepal. We also set up a small facility in Kathmandu to extract DNA from collected fecal specimens in 2014. We have compared mtDNA variations of macaques and langurs in Nepal. Parts of mtDNA (16S rRNA, cyt b, non-coding region) were subjected to the sequencing by a standard procedure and phylogeographical relationship was assessed by molecular phylogenetic and population genetic analyses. Our preliminary data suggested evolutionary proximity of local populations of Himalayan langurs in the sequence comparisons. This kind of close relationship was also observed in the populations of Assamese macaques in Nepal and Bhutan. Taxonomic status of South Asian primates is controversial for both macaques and langurs. Many of previous studies used zoo samples but available information are increasing in recent for wild populations. We hope that we can continue cooperative research to provide reliable information to test evolutionary hypotheses and to measure biological diversity of macaques and langurs in Asia. This program on Himalayan primates can be linked to corresponding programs of the planned research program which covers macaques and langurs in India and Sri Lanka.
Keywords: macaques (M. assamensis; M. mulatta), langurs (Semnopithecus entellus), Nepal.
H26-A24 代:Charmalie AD Nahallage
Study of ecology and phylogeography of primates in Sri Lanka
Study of ecology and phylogeography of primates in Sri Lanka
Charmalie AD Nahallage
The evolution and phylogeny of endemic primates in Sri Lanka are not well understood due to a paucity of comparative studies of their ecology and genetics. The long-term goals of my study are to elucidate aspects of the ecology and phylogeny of the toque macaque and two species of langurs, the gray langur and the purple-face langur in Sri Lanka. Towards this goal we collected 50 fecal samples from toque macaques (N= 11), purple face langurs (N= 3) and grey langurs (N= 36) from 14 populations across Sri Lanka. The samples were preserved in lyses buffer in the field. Samples were transported back to the laboratory at the University of Sri Jayawardenepura and the fecal DNA was extracted at the University of Sri Jayawardenepura. The successfully amplified PCR product was sequenced back in Japan at PRI. Further analyses are currently underway. We hope evaluate their relation with haplotypes in the bonnet macaque to test evolutionary relationship between sinica-group macaques in Sri Lanka and India. We will observe the condition of boundary between the two haplogroups to assess evolutionary change of habitat distribution. For langurs, four subspecies are described in the purple-faced langur but the gray langur is monotypic. MtDNA diversity within and between those taxa will be at first compared using fecal DNA samples. Molecular phylogenetic and phylogeographic relationships among observed haplotypes will be analyzed to test the convergence hypothesis. Field observations are currently being conducted, and based on the obtained results from our molecular DNA analysis we will intensify our search for the possibility of introgression or recent hybridization in candidate habitats targeted from the forthcoming results.
H26-A25 代:Ceridwen Boel
"Integrated studies on development and aging of cognition, physiology and morphology in Primates"
Integrated studies on development and aging of cognition, physiology and morphology in Primates
学会発表 中川浩、二宮太平、高田昌彦、山下俊英 Role of RGMa inhibition in recovery of motor functions and axonal regeneration after spinal cord injury in macaques(2014.9.11) Neuroscience2014.
論文 Tsubamoto, T.(2015) Rare anomalous dental morphologies found in raccoon dog (Nyctereutes procyonoides) and their implication to dental morphology of fossil mammals Journal of the Geological Society of Japan 121(6):185-189. 謝辞あり
Tsubamoto, T.(2019) Relationship between the calcaneal size and body mass in primates and land mammals Anthropological Science 127(1):73-80. 謝辞あり
Tsubamoto, T.(2020) Intrasubspecific variations of the adult astragalar and calcaneal sizes in living Japanese raccoon dog (Nyctereutes procyonoides viverrinus) Memoirs of the Faculty of Science, Ehime University 23:1-11. 謝辞あり
Takehisa Tsubamoto Dental anomalies found in living raccoon dog (Nyctereutes procyonoides) and their implication to dental morphology of Eocene mammals(2017年8月26日) Society of Vertebrate Paleontology(Calgary, Alberta, Canada).
関連サイト doi http://dx.doi.org/10.5575/geosoc.2015.0015
論文 Yoshiyuki Tohno & Setsuko Tohno & Takao Oishi & Takeshi Minami & Pongsak Khanpetch & Cho Azuma & Ranida Quiggins(2014) Age-Related Decrease of the Phosphorus Contentin the Ligamentum Capitis Femoris of Monkeys Biol Trace Elem Res 161:78-81. 謝辞Yes
学会発表 Cho Azuma,Takao Oishi,Yoshiyuki Tohno,Setsuko Tohno,Takeshi Minami,Mayumi Nishi Different Accumulation of Elements in the Tracheal and Bronchial Cartilage of Monkey(2014年3月27日～29日) 第119回日本解剖学会総会・全国学術集会(栃木).
論文 Zhang Y, Kono RT, Wang W, Harrison T, Takai M, Ciochon RL, Jin C (2015) Evolutionary trend in dental size in Gigantopithecus blacki revisited. Journal of Human Evolution 83:91-100. 謝辞あり
Zhang Y, Jin C, Kono RT, Harrison T, Wang W.(2016) A fourth mandible and associated dental remains of Gigantopithecus blacki from the Early Pleistocene Yanliang Cave, Fusui, Guangxi, South China. Historical Biology 28:95-104.
学会発表 河野礼子・張穎奇・金昌柱・高井正成・王?・Terry Harrison ギガントピテクス臼歯サイズの時代変化(2014年11月1日) 第68回日本人類学会大会(浜松).
Kono RT, Zhang Y, Jin C, Takai M, Wang W, Harrison T Size trend of the Gigantopithecus blacki tooth fossils from the Pleistocene cave deposits in southern China.(2014年10月23日) International Symposium on Paleoanthropology in Commemoration of the 85th Anniversary of the Discovery of the First Skull of Peking Man(Beijing,China).
Kono RT, Zhang Y, Jin C, Takai M, Wang W, Harrison T Size trend of the large hominoid tooth fossils from the Pleistocene cave deposits in southern China.(2014年8月15日) International Primatological Society XXV Congress(Hanoi, Vietnam).
Zhang Y, Kono RT, Wang W, Harrison T, Takai M, Ciochon RL, Jin C (in press) Evolutionary trend in dental size in Gigantopithecus blacki revisited. JHE.
DNA analysis of wild rhesus macaques in Southern China
Peng Zhang , Chengfeng Wu, Xia Xunxiang
From September 1st to 20th, I visited Japan and had cooperative researches with Dr. Imai Hiroo, my counterpart at Primate Research Institute of Kyoto University. During my stay at Dr. Imai's lab, I learned the basic techniques to extract DNA from feces and amplify bar-cording regions (mtDNA) by PCR, and to estimate ratio of plant species taken by rhesus macaques in Hainan Province of China. As the results, I improved my method on DNA analysis and successfully extracted genomic DNA from feces samples of wild rhesus macaques. We also tested possible method to determine kin relationship of the study group using microsatellite markers from DNA from feces and fur samplings. I published one book in Chinese and two papers based on the funding supports. From August 11-17 of 2014, I attended the 25th congress of the International Primatological Society at Vietnam and the Bogor Symposium for Asian Primate Research in Indonesia. From 28 June-3 July, 2014, we Invited Prof. Michael A Huffman to visit my primate lab of Sun Yat-sen university, China.
論文 Tsuji Y., Ito T.Y., Wada K., and Watanabe K. Mamm. Rev.(2015) Spatial patterns in the diet of the Japanese macaque, Macaca fuscata, and their environmental determinants Mammal Review in press.
学会発表 Tsuji Y., Ito T., Wada K., Watanabe K. Adaptation to a snowy environment: biogeographical patterns in the diet of the Japanese macaque, Macaca fuscata, and their environmental determinants. (2015年7月 (予定)) Vth International Wildlife Management Congress(札幌).
学会発表 今井啓雄、筒井圭、尾頭雅大、櫻井児太摩、鈴木-橋戸南美、早川卓志、Aureli, F.、Schaffner, C. M.、Fedigan, L. M.、河村正二 新世界ザル苦味受容体機能の種間差(2014年7月4-6日) 第30回日本霊長類学会(大阪大学・大阪科学技術センター、吹田市・大阪市).
Tsutsui, K., Otoh, M., Sakurai, K., Suzuki-Hashido, N., Hayakawa, T., Welker, B. J., Aureli, F., Schaffner, C. M., Fedigan, L. M., Kawamura, S. and Imai, H. Functional diversity of bitter taste receptors in new world monkeys(August 11-16, 2014) The 25th Congress of the International Primatological Society (IPS 2014)(Melia Hotel, Hanoi, Vietnam).
Kawamura, S., Tsutsui, K., Otoh, M., Matsushita, Y., Sakurai, K., Suzuki-Hashido, N., Hayakawa, T., Shirasu, M., Melin A. D., Bergstrom M. L., Welker B. J., Schaffner, C. M., Aureli, F., Fedigan, L. M., Touhara, K. and Imai, H. Towards understanding evolutionary diversity of chemical sensors in New World monkeys with polymorphic color vision(August 11-16, 2014) The 25th Congress of the International Primatological Society (IPS 2014)(Melia Hotel, Hanoi, Vietnam).
Tsutsui, K., Otoh, M., Sakurai, K., Suzuki-Hashido, N., Hayakawa, T., Welker, B. J., Aureli, F., Schaffner, C. M., Fedigan, L. M., Kawamura, S. and Imai, H. Interspecific variation of ligand sensitivity and evolution of bitter taste receptors TAS2R1 and TAS2R4 in New World monkeys(September 25-27, 2014) The 52nd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(Sapporo Convention Center, Sapporo, Japan).
Tsutsui, K., Otoh, M., Sakurai, K., Suzuki-Hashido, N., Hayakawa, T., Welker, B. J., Aureli, F., Schaffner, C. M., Fedigan, L. M., Kawamura, S. and Imai, H. Interspecific variation in ligand sensitivity of G-protein-coupled bitter taste receptors in New World monkeys.(October 5-10, 2014) 16th International Conference on Retinal Proteins(Nagahama Royal Hotel, Nagahama, Japan).
Tsutsui, K., Otoh, M., Sakurai, K., Suzuki-Hashido, N., Hayakawa, T., Welker, B. J., Aureli, F., Schaffner, C. M., Fedigan, L. M., Kawamura, S. and Imai, H. Interspecific variation of ligand sensitivity and evolution of bitter taste receptors TAS2R1 and TAS2R4 in New World monkeys(November 2-3, 2014) 12th International Symposium on Molecular and Neural Mechanisms ofTaste and Olfactory Perception(Kyushu University, Fukuoka, Japan).
筒井圭、尾頭雅大、櫻井児太摩、鈴木-橋戸南美、早川卓志、Welker, B. J., Aureli, F.、Schaffner, C. M.、Fedigan, L. M.、河村正二、今井啓雄 新世界ザルの苦味受容体応答の種間差(2015年1月31日) 第59回プリマーテス研究会(日本モンキーセンター、犬山).
Molecular characterization of HERV-Y family in primates
Molecular characterization of HERV-Y family in primates
Heui-Soo Kim , Jungwoo Eo , Hee-Eun Lee
Endogenous retroviruses (ERVs) inserted into the genome early in primate evolution. Human ERVs (HERVs) occupy about 8% of the human genome. In this study, we identified novel HERV-Y elements among 31 families. The full-length HERV-Y is located on chr8 and chr13 (HERV-Y101, -Y102, and -Y103; Table 1), and clustered with HERV-I,-T,-E, and –R in the pol-based phylogenetic relationship. HERV-Y pol were ubiquitously transcribed in human tissues, and also highly expressed in rhesus monkey. In addition, we observed high expression patterns in tissues from African green moneky and cotton-top tamarin, suggesting biologically important roles of HERV-Y gene products in primates.
H26-B19 代:小島 大輔 協:鳥居 雅樹
霊長類の光感覚システムに関わるタンパク質の解析
霊長類の光感覚システムに関わるタンパク質の解析
小島 大輔 , 鳥居 雅樹
脊椎動物において、視物質とは似て非なる光受容蛋白質（非視覚型オプシン）が数多く同定されている。これまでに私共は、マウスやヒトの非視覚型オプシンOPN5がUV感受性の光受容蛋白質であることを見出し（Kojima et al., 2011）、従来UV光受容能がないとされていた霊長類にも、UV感受性の光シグナル経路が存在することが示唆された。そこで本研究では、OPN5を介した光受容が霊長類においてどのような生理的役割を担うのかを推定するため、霊長類におけるOPN5の発現パターンや分子機能を解析している。本年度は、ニホンザル組織よりクローニングしたOPN5 cDNAの分子機能を調べるため、哺乳類培養細胞系を用いたCaイメージング解析を行った。ニホンザルOPN5 cDNAを強制発現させた培養細胞に11シス型レチナールを添加した後、近紫外光パルス（387 nm）を照射したところ、細胞内Ca++濃度の一過的な上昇が観察された。このニホンザルOPN5 cDNAは、近紫外光受容体をコードすると考えられる。
Genetic diversity of long-tailed macaque Macaca fascicularis and rhesus macaque M. mulatta: mainly focus on their hybridization range
論文 BUNLUNGSUP, S., IMAI, H., HAMADA, Y., GUMERT, M.D., SAN, A.M., MALAIVIJITNOND, S.( 2016) Morphological Characteristics and Genetic Diversity of Burmese Long-TailedMacaques (Macaca fascicularis aurea) American Journal of Primatology 78: 441-455. 謝辞 Acknowledged
学会発表 Bunlungsup S, Imai H, Hamada Y, Krudthong P, Gumert M, Malaivijitnond S. What is different about the Burmese long-tailed macaques?(20 August 2014) Kyoto University and Bogor Agricultural University International Symposium: Diversity and Conservation of Asian Primates(Bogor, Indonesia).
Genetic diversity of long-tailed macaque Macaca fascicularis and rhesus macaque M. mulatta: mainly focus on their hybridization range
Srichan Bunlungsup , Suchinda Malaivijitnond
To determine the hybridization between M. f. fascicularis and M. f. aurea, blood and fecal samples of these two subspecies and the hybrid throughout Thailand and Myanmar in total 16 populations were collected. The species and subspecies of monkeys were first identified in regard to their morphological characteristics. HVSI on D-loop region was amplified to trace the genetic structure in macaque populations. SRY and TSPY genes were analyzed to trace the migration pattern. Then, mtDNA and Y-chromosome trees were constructed with 1000 bootstraps using Neighbor joining method. From our result, we proposed two hypothesized about their migration routes. Firstly, aurea population migrated southward along the Mergui Archipelago towards the southwestern Thailand, probably during the glacial period. After that, some of them may migrate north eastward across the low altitude of Tanasserim Hills towards mainland Thailand and islands on Thai Gulf respectively.
論文 Okashita N., Kumaki Y., Ebi K., Nishi M., Okamoto Y., Nakayama M., Hashimoto S., Nakamura, T., Sugasawa K., Kojima K., Takada T., Okano M., and Seki, Y.(2014) PRDM14 promotes active DNA demethylation through the Ten-eleven translocation (TET) mediated base excision repair pathway Development 141:269-280.
学会発表 Takada T., Shimozawa N., Shirai E., Higaki S., Ono Y., Suemori H., Narita K., Takeda S., Ohta Y. Labeling of motile multiple-flagellated cells differentiated from non-human primate ES and iPS cells(15-17 2015) The 18th Takeda Science Foundation Symposium on BioscienceiPS cells for Regenerative medicine, CiRA International Symposium(Osaka).
東京都及び隣接域の埼玉県、山梨県、神奈川県に生息する個体群は、mtDNA解析（Kawamoto et al,2007）により、関東でありながら遺伝子タイプは西日本タイプに近く、最終氷河期の遺存個体群である可能性が予想されている。 これらの個体群は1980年から生息状況調査を実施しており、生息群の内58群を特定している。また、オスの群間移動のデータも蓄積されつつある。だが、いずれも観察に基づくものであり、遺伝学調査についての蓄積はない。 2014年は共同利用研究により、mtDNAとY染色体に見られる変異からこれらの地域に生息するニホンザルの成立過程及び地域内の遺伝子構成を解明する基盤として東京都、埼玉県、山梨県の生息群から糞試料149検体（2013年も含む）、群れオスと群れ外のオスグループから糞試料14検体を採取した。 試料は特定群ごとにまとめ、mtDNAの塩基配列分析とamelogenin標識遺伝子による性判別の実験をおこない、群れに固有のタイプを特定して、その分布図を作成した。 この結果、調査地域内のサルは他地域から大きく分化したmtDNAタイプを有すること、地域内においてもmtDNAの多様性が大きいこと、タイプの分布に地理的構造が予想されることが観察されはじめている。また、オスを介した地域間交流についても遺伝子データが蓄積されつつある。 2015年については、東京都、神奈川県を含めて検体の採取数を増加させて地域内の遺伝子構成を密に解明するとともに、オスの検体を採取してオスを介した地域間交流の実態解明をおこなう。
H26-B24 代:澤野 啓一
霊長類における眼窩骨壁の構造と眼球開眼領域の形態との関連性に関する研究
学会発表 Sawano K1,4,10, Yokoyama T2, Yoshikawa S2, Tanaka T3, Kato T3, Takahashi T1,, Dodo Y5, Suzuki T6, Sawada H7, Hamada Y8, Kawada S9, Hagiwara H4, Inoue T4, Kawahara N2 Morphological studies on the inner orbital wall in the extant Catarrhini including humans. A Comparison of CO, FOS, FOI, FGL, and FSL.(2014年11月2日) The 68th Annual Meeting of the Anthropological Society of Nippon(静岡県浜松市).
Sawano K1,5), Tanaka T2), Suzuki T3), Sawano M4), Nakagawa K1), Hasegawa I1), Ohira H1), Yamamoto I1), Yamada Y1) (澤野啓一, 田中健, 鈴木敏彦, 澤野宗顕, 中川貴美子, 長谷川巌, 大平寛, 山本伊佐夫, 山田良広) The function of the human bony orbital wall and its phylogenetic history, revealed from studies on bony orbital damage cases.(2017年6月9日) The 101st Congress of the Japanese Society of Legal Medicine (Gifu City, Japan).
霊長類における眼窩骨壁の構造と眼球開眼領域の形態との関連性に関する研究
澤野 啓一
Fissura orbitalis superior(FOS)は、Homo ではCanalis opticus(CO)の何倍もの大きさが有り、「くの字型」に屈曲している。しかしPongo, Pan, Gorilla では、FOS の横断面形状はFissura と言うよりも、むしろ歪んだ円形もしくは四角形に近い状態であり、Homo とは大いに異なる。 Fissura orbitalis inferior (FOI)は、Homo ではOrbita の外側下方に最大口径を持つ大型水滴状の断面形状によって側頭窩・側頭下窩に開口し、その断面積は個人差が大きいものの、少なくともFOS と同等か、更にそれを上回る。このように相対的に大型のFOI を持つのは、現生Catarrhini ではHomo だけであり、それに準ずるのがHylobatesである。 それに反して、Papio, Mandrillus等では、FOIは非常に狭く小さくて、1〜2 mm程度の細い電線を挿入できる程度である。Macacaの場合にもその状態に近い。 Great apesの場合には、その大きさはCercopithecoideaよりも大きいが、Homoよりもはるかに狭い。 霊長類は、原始的な状態から高度に発達した状態に成るに従って、Orbitの壁が閉鎖的に成るという傾向を指摘されることが多い。上記の観察結果は、これに反する事例として非常に興味深い。視線の制御は、体軸と眼球運動の制御によって行われる魚類段階から、爬虫類・哺乳類段階では頚部運動中心方式に転換された。それが、霊長類進化の過程で、頚部運動・眼球運動併用方式に再度修正されて来た。bony orbital socketの壁面開口部構造と眼球開眼領域の形態は、そうした視線制御方式の改変、及び脳頭蓋内外の連絡路の改変とを反映しているものと考えられる。
遺伝子解析により、中部地方に生息するニホンザルの群れや地域集団の類縁関係を明らかにし、地域個体群の成立過程を検討することを目的にして、DNA試料の野外採集と分析を行った。 2015年9月から11月にかけて、岐阜県根尾川、揖斐川流域と福井県九頭竜川源流の雲川流域でDNA試料の糞を採集した。この地域はサルの生息情報が少なく、過去に遺伝子調査が行われていない地域である。分析の結果、ミトコンドリアDNA調節領域(mtDNA-CR)(1015塩基対)から、 Aタイプ(揖斐川上流)、Bタイプ(根尾川上流)、Cタイプ(揖斐川上流、根尾川上流、雲川)、Dタイプ(揖斐川中流、揖斐川支流坂内川)の四つのハプロタイプを検出した。4タイプの第二可変域(412塩基対)に注目して、ハプロタイプを分類(Kawamoto et al 2007)すると、AはJN21タイプ、BはJN22タイプ、CとDはJN30タイプであった。更に、DNAによる性判別で、A,C,Dはメスの個体を含む集団であることを確認した。揖斐川上流に生息するAタイプ(JN21)は、先行研究により石川県手取川、岐阜県長良川流域の生息分布が確認されており、この集団が更に揖斐川上流域に至っていることが分かった。C、Dタイプ(JN30)は三重県東部、岐阜県西部、福井県南部の生息分布が知られていたが、揖斐川、根尾川、雲川流域の分布が確認されたことにより、三重県、岐阜県、福井県にかけて広域的に生息する血縁集団であることが明らかになった。
論文 Ushida K, Tsuchida S, Ogura Y, Hayashi T, Sawada A, Hanya G(2016) Draft genome sequences of Sarcina ventriculi isolated from wild Japanese macaques in Yakushima island Genome Announcements 4:e01694-15. 謝辞あり
学会発表 Ikezono T, Matsumura T, Matsuda H, Saitoh S, Usami S, Suzuki M, Ogawa K Perilymphatic fistula, clinical characteristics revealed by novel biochemical diagnostic marker(2014/9/13-16) 7th Instructional workshop of European Academy of Otology and Neuro-Otology( Siena,Italy).
Ikezono T, Matsuda H, Shindo S, Matsumura T, Sekine K, Saitoh S, Usami S Proteomics and the inner ear. ?Insights to cochlin function and identification of a novel biomarker for deafness and dizziness-( 2014/9/13-16) 7th Instructional workshop of European Academy of Otology and Neuro-Otology( Siena,Italy).
Ikezono T Biomarker For Dizziness and Hearingloss. - CTP will help us better understand inner ear diseases -( 2014.12.6) Annual meeting of the Korean Balance Society 2014( Seoul, Korea).
Ikezono.T , Matsumura.T, Matsuda.H, Saito.S, Usami.S, Suzuki.M, Ogawa.K Perilymphatic Fistula Diagnostic Criteria of Japan( 2014/4/3-5) 15th KOREA JAPAN joint meeting of Otorhinolaryngology-Head and Neck Surgery( Seoul,Korea).
Matsumura T , Matsuda H , Saito S , Usami S, Suzuki M , Ogawa K, Ikezono T Evaluation of diagnostic accuracy of ELISA based CTP detection test for Perilymphatic Fistula( 2014/4/3-5) 15th KOREA JAPAN joint meeting of Otorhinolaryngology-Head and Neck Surgery( Seoul,Korea).
Matsuda H, Matsumura T, Saitoh S, Ikezono T, Usami S, Suzuki M, Ogawa K The clinical characteristics of the definitive PLF cases diagnosed by CTP test( 2014/4/3-5) 15th KOREA JAPAN joint meeting of Otorhinolaryngology-Head and Neck Surgery( Seoul,Korea).
Yuki Nonaka, Kota Katayama, Kei Tsutsui, Hiroo Imai, Hideki Kandori FTIR study of monkey blue-sensitive visual pigment(September 26th 2014) The 52nd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(Sapporo, Japan).
Tomoaki Ohashi, Kota Katayama, Masayo Iwaki, Kei Tsutsui, Hiroo Imai, Hideki Kandori ATR-FTIR study of ligand binding in a bitter taste receptor(September 27th 2014) The 52nd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(Sapporo, Japan).
Yuki Nonaka, Kota Katayama, Kei Tsutsui, Hiroo Imai, Hideki Kandori FTIR study of a primate blue-sensitive visual pigment(October 5-10th 2014) The 16th International Conference on Retinal Proteins(Nagahama, Japan).
Kenji Ichiyanagi Evolution of primate epigenomes and its association with regulatory elements, transposable elements, and nuclear architecture(2015年3月16-17日) Progress 100: Kyushu-U and Stanford-U Joint Research and Education Program "From Genes to Human Diseases(福岡).
Kei Fukuda Impact of retrotransposons on evolution of the germ-line epigenome in primates(2015年3月26日) 2nd International Seminar on Retroelement, Mobile Genetic Elements, and Genome Evolution(熊本).
霊長類におけるエピゲノム進化の解明
一柳 健司 , 佐々木 裕之, 福田 渓
我々は霊長類におけるゲノム進化とエピゲノム進化の関係を解明するため、ヒト、チンパンジー（霊長類研究所の飼育個体）、ゴリラおよびオランウータンの末梢白血球のDNAメチル化比較研究を行い、CTCFタンパク質の結合配列の出現・消失やマイクロサテライト配列の小さな変化によって、DNAメチル化状態が変化し、転写状態に影響を与えていることを世界で初めて示した（Fukuda et al. 2013, J. Human Genet.58:446-454）。 前年度にGAINよりニホンザル精子サンプルを供与頂き、全ゲノムレベルでDNAメチル化状態を解析した。本年度はさらに解析を進め、ヒト、チンパンジー、ニホンザルの精子メチル化状態の3種比較を行い、ヒト特異的に大きな低メチル化領域（数十kb以上）が多数出現していることを明らかにした。一方、小さな領域（1kb以下）のメチル化変化については、SVAやAluといったレトロトランスポゾンの種特異的な挿入により、周辺のエピジェネティック状態が変化することを明らかにした。SVAはヒト集団内にも多数の挿入多型があることが知られている。そこで、数人のヒト精子サンプルについてメチル化状態を解析し、ヒト集団内でもSVA挿入によって、周辺のDNAメチル化が低下することを明らかにした（論文投稿中）。
学会発表 Miyuki KAGAYA, Hirohiko AOYAMA, Yuzuru HAMADA Three-dimensional movement of the shoulder girdle in macaque in passive forelimb elevation(2014年8月) 第25回国際霊長類学会(ハノイ、ベトナム).
論文 Naka I, Patarapotikul J, Hananantachai H, Imai H, Ohashi J(2014) Association of the endothelial protein C receptor (PROCR) rs867186-G allele with protection from severe malaria Malaria Journal 13:105. 謝辞あり
論文 Kosuke Itoh, Masafumi Nejime, Naho Konoike, Tsutomu Nakada, Katsuki Nakamura(2015) Noninvasive scalp recording of cortical auditory evoked potentials in the alert macaque monkey Hearing Research 327:117-125. 謝辞The work was supported by the Ministry of Education, Culture, Sports, Science, and Technology (Japan), JSPS KAKENHI Grant Number 25540052, and the Cooperative Research Program of the Primate Research Institute, Kyoto University.
論文 Miura M, Yasunaga J, Tanabe J, Sugata K, Zhao T, Ma G, Miyazato P, Ohshima K, Kaneko A, Watanabe A, Saito A, Akari H, Matsuoka M.(2013) Characterization of simian T-cell leukemia virus type 1 in naturally infected Japanese macaques as a model of HTLV-1 infection. Retrovirology 10:118. 謝辞あり
Ma G, Yasunaga J, Akari H, Matsuoka M.(2015) TCF1 and LEF1 act as T-cell intrinsic HTLV-1 antagonists by targeting Tax. Proc Natl Acad Sci U S A. 112(7):2216-21. 謝辞あり
H26-B56 代:Cynthia Thompson 協:Chris Vinyard 協:Susan Williams
Developing a model of cold-stressed primate thermoregulation from Japanese macaques (Macaca fuscata).
Developing a model of cold-stressed primate thermoregulation from Japanese macaques (Macaca fuscata).
Cynthia Thompson , Chris Vinyard, Susan Williams
This project had a successful first year. In December 2014, animals were captured and implanted with temperature loggers. During our data collection trip from December 10-23, 2014 we successfully obtained 331.25 hours of focal animal behavioral observation, 274 infrared images, 79 fecal samples (to measure hormones), and continuous weather station data. Our preliminary data indicate that Japanese macaques utilize behavioral thermoregulation during the winter. There is a significant trend for animals to use heat conserving postures (e.g. curled with limbs on body and ventrum covered) when ambient temperatures are lower (JT=4.26, P<0.001). Similarly, animals use heat conserving postures when solar radiation in lower (JT=2.06, P<0.039). However, wind speed and rain did not significantly impact posture. During this winter sample, animals also positioned themselves in sunny over shady locations during times with higher solar radiation (F=53.6, P<0.001). Likewise, sunbathing sessions with the ventrum exposed occurred during times of higher solar radiation (x ̅=345.3 W/m2) than sun exposure to the dorsum or lateral areas (x ̅=287.7 W/m2), although this difference did not reach statistical significance. Analyses of thyroid hormone levels and infrared images have not yet been conducted. A comparative summer sample will be collected in July 2015, followed by retrieval of loggers to obtain body temperature measurements.
H26-B57 代:郷 康広
霊長類のゲノム・トランスクリプトーム・エピゲノム研究
論文 Oishi T, Imai H, Go Y, Imamura M, Hirai H, Takada M.(2014) Sporadic premature aging in a Japanese monkey: A primate model for progeria. PLoS ONE 9(11):e111867.
Hayakawa T, Suzuki-Hashido N, Matsui A, Go Y.(2014) Frequent expansions of the bitter taste receptor gene repertoire during evolution of mammals in the Euarchontoglires clade. Mol Biol Evol. 31(8):2018-2031.
学会発表 Yasuhiro Go Direct estimation of genome-wide mutation rate in a chimpanzee family trio by ultra deep whole genome sequencing.(2014年7月27日) MHC evolution and Human evolution symposium(神奈川(葉山)).
論文 Adach, A. and Miura(2014) Animal model studies on viral infections. Frontiers in Microbiology 5:Article 672.
Otsuki, H., Yoneda, M., Igarashi, T., and Miura, T.(2014) Generation of a monkey-tropic human immunodeficiency virus type 1 carrying env from a CCR5-tropic subtype C clinical isolate. Virology 460-461:1-10.
学会発表 Yohey Terai, Hiroo Imai, Kanthi Arum Widayati, Bambang Suryobroto Genomic regions responsible for speciation in Sulawesi macaques: approach from high-throughput sequencing analysis(18-21 Agustus 2014) Kyoto University and Bogor Agricultural University International Symposium: Diversity and Conservation of Asian Primates: From Molecule to Culture(Bogor, Indonesia).
Genomic Evolution of Sulawesi Macaques
Bambang Suryobroto
Sulawesi macaques are exceptional as the seven species evolved allopatrically in an island that is less than 5% of the whole coverage area of the genus Macaca. The island itself is part of the zoogeographical realm called Wallacea which is highly endemic. There are three issues regarding the evolution of Sulawesi macaques. The first is taxonomic status, the second phylogenetic relationship, and the third hybrid population problem. Recent development in DNA technology (next generation sequencing, NGS) leads to the ability to read the whole genome of an individual. This immense genomic data provide an opportunity to find the most taxonomically informative loci to base the phylogenetic hypotheses and also to observe the gene dynamics of hybrid population. Dr. Yohei Terai (Soken-dai) and I took fecal samples of M. maurus, M. nigra, M. hecki, and M. tonkeana from the island and in Japan we made library for the whole genomic sequencing. We used exome approach so the NGS libraries were hybridized to exon capture sequence. Quality of the exomic library is quite good, for instance, for one sample of M. nigra we got molecules from 278bp to 1300bp with average 561bp and their concentration was 31.5ng/ul. We performed NGS using Illumina Myseq machine to determine 300bp reads from both ends and we could get 75,339,456 sequences. We mapped the sequences to reference genome which is the genome of M. mulatta. The analysis is now on going.
H26-B63 代:Laurentia Henrieta Permita Sari Purba
Variation of Gene Encoding Receptor of PTC bitter taste Compound in Leaf-eating Monkeys
学会発表 Hiroo Imai, Takashi Hayakawa, Nami Suzuki, Yamato Tsuji, Hiroshisa Hirai, Laurentia Henrieta, Sarah Nila, Kanthi Arum Widayati, Bambang Suryobroto Next Generation Analysis of Indonesian Colobines(18-21 Agustus 2014) Kyoto University and Bogor Agricultural University International Symposium: Diversity and Conservation of Asian Primates: From Molecule to Culture(Bogor).
Variation of Gene Encoding Receptor of PTC bitter taste Compound in Leaf-eating Monkeys
Laurentia Henrieta Permita Sari Purba
T2R38 is one of T2R multigene families that encode receptor to recognize bitter from PTC compound. In primates, T2R38 had been identified in human, chimpanzee, Japanese macaques and exhibit intra-species polymorphism. Polymorphism in this gene lead to different behavioural response of individual. Taster individual show aversion to bitterness from PTC, in contrast to tolerant in non-taster individuals. Leaf-eating monkeys (Subfamily Colobines) are unique among primates because their diet mostly consisted of leaves that perceptually tasted bitter to human. Based on behavioral experiment, Chiarelli (1963) found that five individuals of three species of Colobines have non-taster phenotype. Thus, we conducted preliminary behavioral experiments of PTC-tasting on leaf-eating monkeys kept in Ragunan Zoo. The result indicated that nine individuals of genus Trachypithecus, Presbytis and Nasalis were all non-tasters. Genomic DNA of leaf-eating monkey was obtained from fecal samples. After DNA extraction, T2R38 gene region was specifically amplified using standard PCR reaction. The result showed that there are some polymorphisms in the T2R38 genes of T. auratus and T. cristatus. To know whether the T2R38 receptor of leaf-eating monkeys is functional or not, we are trying to conduct functional assay based on cell expression.
H26-B64 代:東原 和成 協:松井 淳
霊長類の嗅覚・フェロモン受容体の多様性と進化
論文 Yoshihito Niimura,Atsushi Matsui, Kazushige Touhara(2014) Extreme expansion of the olfactory receptor gene repertoire in African elephants and evolutionary dynamics of orthologous gene groups in 13 placental mammals Genome Research 24(9):1485-1496.
松井淳、東原 和成(2014) 嗅覚受容体 医学のあゆみ 249(5):370.
学会発表 Atsushi Matsui Comparative genomics of olfactory receptor genes in primates(12th, March, 2014) Workshop on methods for biodiversity research(Shanghai, China).
新村 芳人、松井 淳、東原 和成 Expansion and contraction of the olfactory receptor universe: Orthology among 13 placental mammals highlights the evolutionary fate of genes(2014年4月26日) 第14回東京大学生命科学シンポジウム(東京).
論文 Kikuchi Y, Kuraoka A(2014) Differences in muscle dimensional parameters between non-formalin-fixed (freeze-thawed) and formalin-fixed specimen in gorilla (Gorilla gorilla). Mammal Study, 39, 1, 65-72 39:65-72. 謝辞あり
Bastir M, Garcia-Martinez D, Williams SA, Recheis W, Torres-Sanchez I, Rioe FG, Oishi M, Ogihara N(2017) 3D geometric morphometrics of thorax variation in Hominoidea Journal of Human Evolution 113:10-23. 謝辞あり
Oishi M, Ogihara N, Shimizu D, Kikuchi Y, Endo H, Une Y, Soeta S, Amasaki H, Ichihara N (2018) Multivariate analysis of variations in intrinsic foot musculature among hominoids Journal of Anatomy 232(5):812-823. 謝辞あり
論文 Emura K, Arakawa T, Miki A, Terashima T(2014) Anatomical observations of the human acromioclavicular joint Clin Anat 27(7):1046-1052.
Matsumoto A, Fujita N, Arakawa T, Fujino H, Miki A(2014) Influence of electrical stimulation on calpain and ubiquitin-proteasome systems in the denervated and unloaded rat tibialis anterior muscles. Acta Histochem. 116(5):936-42.
Hatade T, Takeuchi K, Fujita N, Arakawa T, Miki A(2014) Effect of heat stress soon after muscle injury on the expression of MyoD and myogenin during regeneration process. J Musculoskelet Neuronal Interact. 14(3):325-33..
Gessho T, Arakawa T, Terashima T, Miki A Comparative study of the innervation pattern to the plantarismuscle between human and non-human primates(2015年3月21日) 第120回日本解剖学会総会・全国学術集会(兵庫県神戸市).
Kenji Emura, Takamitsu Arakawa, Toshio Terashima Anatomical study on the flexor digitorum superficialis in common marmoset (Callithrix jacchus)(2015/3/21) 第120回日本解剖学会総会・全国学術集会(兵庫県神戸市).
Yuko Watanabe, Takamitsu Arakawa, Toshio Terashima, Ikuo Kageyama, Katsuji Kumaki The great cardiac vein and the anterior inter ventricular branch of left coronary artery covered with myocardium: A case report(2015/3/21) 第120回日本解剖学会総会・全国学術集会(兵庫県神戸市).
Daijiro Haba, Yuko Watanabe, Takamitsu Arakawa, Toshio Terashima, Ikuo Kageyama, Katsuji Kumaki Akinori Miki Constantly existence of the sensory branch in the nerve to the pyramidalis muscle and gender difference of the course in the nerve(2015/3/21) 第120回日本解剖学会総会・全国学術集会(兵庫県神戸市).
Takamitsu Arakawa, Akinori Miki, Ikuo Kageyama, Katsuji Kumaki A case study of both sides of the vertebral arteries passing through the 3rd transverse foramen and branches from the sympathetic trunk(2015/3/21) 第120回日本解剖学会総会・全国学術集会(兵庫県神戸市).
論文 K Ochiai, S Hayama, S Nakiri et al. (2014) Low blood cell counts in wild Japanese monkeys after the Fukushima Daiichi nuclear disaster. Scientific Reports 4: 5793 . 謝辞あり
学会発表 S. Hayama1, K. Ochiai1, S. Nakiri1, S. Nakanishi2 N. Ishii1, T. Uno1, T. Kato1, F. Konno3, Y. Kawamoto4, T. Tsuchida1, T. Omi1 HEMATOGENOUS FUNCTIONS AND MUSCLE RADIOCESIUM CONCENTRATIONS IN WILD JAPANESE MONKEYS AFTER FUKUSHIMA DISASTER(2014年8月) IPS(ハノイ、ベトナム).
福島市に生息する野生ニホンザルの放射能被曝影響調査
羽山 伸一 , 中西 せつ子 , 石井 奈穂美, 名切 幸枝, 加藤 卓也, 近江 俊徳
[目的]2011年3月に発生した東日本大震災による福島第1原子力発電所の爆発により、福島県に生息するニホンザル（以下,サル）が放射性物質に被ばくした。そこで, 福島市のサルを対象として、被ばくによる健康影響を明らかにすることを目的として、福島県ニホンザル特定鳥獣保護管理計画による個体数調整で捕殺された個体を解剖検査し、妊娠率、筋肉中セシウム測定、臓器及び遺伝子等の標本保存を行った。また、2012年度から本共同利用研究の一環として実施してきた血液検査の結果（Ochiai et al, 2014）で血球数の減少が観測されたため、今年度も血液検査を継続した。 [材料・方法]2014年度は124頭を回収し、解剖した。妊娠率は、Hayama et al(2012)の方法にしたがって推定した。筋肉中放射性セシウム濃度の測定は、解剖時に筋肉を1kg程度採取し、公定法に従って蓄積量を測定した。 [結果と考察] 保存している臓器や血液等は現在、分析中である。筋肉中放射性セシウム濃度は、 2013年の春以降から500Bq/kg 前後を推移し、漸減傾向にあるが、越冬期に濃度が上昇する現象以外に個体により高い値を示すものが観測された。これらの個体の捕獲時期と京都大学等が大気降下物中に高濃度の放射性セシウムを観測した時期がほぼ一致したことから（図）、現在でも原発からの放射性物質の放出が続いていると推察された。また、妊娠率は2013-14年妊娠期と2014-15年妊娠期を合算し、37.5％（6/16）と推定された。妊娠率の観測は2008-09年妊娠期から継続しており、これまでは50％前後で推移してきたが、これに比べてやや低い結果となった。
Tomoko Sakai Brain development in chimpanzees: a combined MRI and Ultrasound study(2015年2月17日) Department of Radiology, Johns Hopkins University School of Medicine, Seminar(Baltimore).
論文 Watanabe Y, Uenoyama Y, Suzuki J, Takase K, Suetomi Y, Ohkura S, Inoue N, Maeda KI, Tsukamura H (2014) Oestrogen-induced activation of preoptic kisspeptin neurones may be involved in the luteinizing hormone surge in male and female Japanese monkeys. J Neuroendocrinol 26(12):909-917. 謝辞あり
論文 He, H., Kubo, K., & Kawai, N.( 2014) Spiders do not evoke greater early posterior negativity in the event-related potential as snakes. NeuroReport 25( 13): 1049-1053.
Hongshen He・久保賢太・川合伸幸 Spider is not special comparing with other animals in human early visual attention: Evidence from event-related potentials.( 2014/9/18-20) 日本認知科学会第31回大会( 名古屋大学（名古屋市）).
論文 Hosaka, Kazuhiko(2015) Hunting and food-sharing In: Mahale Chimpanzees: 50 Years of Research (eds. Nakamura M, Hosaka K, Itoh N, Zamma K), Cambridge University Press, Cambridge, UK.:274?290.
野生チンパンジーのアルファ雄の肉分配に関する研究
保坂 和彦
本年度はマハレのチンパンジー研究50周年を記念して出版される予定の学術図書の編著に必要な文献調査に研究活動のほとんどの時間を費やした。研究課題に関連してまとめた担当章は、第20章「狩猟と食物分配」、第23章「老年学」、第27章「雄間関係」である。第20章には、2010年の第23回国際霊長類学会京都大会で口頭発表した狩猟の更新資料(1996～2010年）の一部を盛り込んだ。第23・27章には、老齢個体ないし大人雄の繁殖・性行動、社会行動、肉食など多角的な視点のレビューワークと新情報を盛り込んだ。本課題に関する内容としては、アルファ雄が獲物の肉を所有的に保持するとき、肉を分け合う個体は同盟個体だけではなく老齢個体が目立つ、という事実に注目して論じた。Nishida et al.(1992)はアルファ雄の連合戦略の観点から前者の重要性を強調したが、後者は事実に言及したのみで発展的な考察はない。他地域から出された論文は、そもそも肉分配を他個体との関係構築・維持に作用する行動戦略として捉える視点が希薄である。今後は、角度を変えた行動分析を試みるとともに、濫立する仮説の検証を進め、「アルファ雄はなぜ肉を他個体と分け合うのか？」という積年の問題に答えていきたい。
H26-D10 代:Young-A Lee
Near-infrared spectroscopy measurement of brain activity associated with visual information integration in Japanese macaques
Near-infrared spectroscopy measurement of brain activity associated with visual information integration in Japanese macaques
In 2014, we generated extensive RNA-seq data for the orang-utan testis sample from the Primate Research Institute, Kyoto University. We are using this important data (which fills a phylogenetic gap in our studies) in various ongoing transcriptome evolution projects, including projects on the evolution of mammalian Y chromosomes, evolution of primate untranslated regions, the evolution of primate alternative splicing, and the origin and evolution of mammalian retrogenes. The latter project is completed and a manuscript will soon be submitted, with several colleagues (Takashi Hayakawa, Yasuhiro Go, Hiroo Imai) from the Primate Research Institute as co-authors. The study described in this paper illuminates how intronless gene copies, which originated from mRNAs of parental source genes through a process called retroduplication (or retroposition), evolved and/or recruited regulatory elements (e.g., promoters) complex gene structures (exons/introns) and thus surprisingly complex new gene functions. This work thus provides general insights into how new genes may arise. It therefore also highlights the power of retroposed genes as a model for the elucidation of new gene functions and will inform future studies of other mechanisms underlying new gene origination, such as segmental duplication and de novo gene origination.
H26-D12 代:小野 英理
マカクの繁殖に関連する性皮変化の分子基盤研究
論文 Eiri Ono, Juri Suzuki and Takafumi Ishida(2015 (in press)) Spectrocolorimetry visualized differences in sexual skin coloration in macaques Folia Primatologica. 謝辞あり
論文 Naoki Morimoto, Gen Suwa, Takeshi Nishimura, Marcia S. Ponce de Leon, Christoph P.E. Zollikofer, C. Owen Lovejoy, Masato Nakatsukasa(2015) Let bone and muscle talk together: a study of real and virtual dissection and its implications for femoral musculoskeletal structure of chimpanzees. Journal of Anatomy in press. 謝辞あり
